行為醫學所（以下簡稱本所）於民國 85 年奉准成立，86 學年度開始招生。 最初依教學分組招收甲組 (臨床心理學含健康心理與神經心理)、乙組 (社會與健康行為)、丙組 (行為神經科學) 學生。 89 學年度起變更為甲組 (臨床心理學)、乙組 (行為神經科學)、丙組 (精神醫學) 三個組別。 108學年度起變更為甲組 (臨床心理學組) 與乙組 (精神醫學) 兩個組別。

本所隸屬於醫學院，目前專任教師 5人、合聘教師 6人、兼任教師5名，所僱用辦事員 1 人。截至109年 2月本所學生計有32名。

自107年8月至112年1月止，由陳柏熹教授擔任所長。

自112年2月起，由曾懷萱副教授擔任所長。